Shadow Empires ha introdotto un nuovo concetto di gioco - le fazioni. All'inizio del gioco, i giocatori selezionano la tribù e in più una fazione. Ci sono 5 fazioni. Ogni fazione inizia il gioco in una posizione diversa nella mappa:

Impero – al centro	Dinastia – a sud-est
Ribelli – a nord-ovest	Orda – a est
Devastatori – a nord

All'inizio i nuovi giocatori di una specifica fazione partiranno nella stessa regione. Una volta riempita, i nuovi giocatori partiranno in un'altra regione vicina e così via. Non dipende più dal quadrante o dalla distanza dal centro della mappa.

Regioni

Le fazioni non solo determinano la posizione iniziale dei giocatori ma introducono anche un nuovo livello di cooperazione tra i giocatori.

Ora le regioni vengono conquistate dalle fazioni e non dalle alleanze individuali. Sia le fazioni che le alleanze che hanno aiutato a conquistare le regioni, prenderanno dei punti vittoria, ma solo un'alleanza potrà accedere al potere antico della regione. Per ulteriori dettagli leggi l'articolo sulle regioni e i poteri antichi.

I giocatori e le alleanze nelle fazioni

I giocatori scelgono la loro fazionne all'inizio del gioco e non potrà più cambiare questa scelta.

L'alleanza appartiene alla fazione del giocatore che l'ha creata. Anch'essa non potrà essere cambiata in seguito.

Tuttavia i giocatori possono entrare in qualsiasi alleanza che vogliono. Anche se hai iniziato a giocare per i Ribelli, puoi entrare nell'alleanza che appartiene all'Orda o ad altra fazione.